과학자들이 단백질을 설계하고 프로그래밍하는 데 도움이 되는 플랫폼인 Cradle은 오늘 최초의 바이오 개발자 설문 조사 결과를 발표했습니다. 이 설문 조사에서는 합성 생물학 분야 내에서 동향을 파악하기 위해 생물학적 개발자의 접근 방식과 우선 순위를 탐색했습니다. 이 설문 조사에는 150명 이상의 바이오 개발자가 참여했으며 과학용 소프트웨어 구축에 중점을 둔 글로벌 커뮤니티인 Bits in Bio와 협력하여 수행되었습니다.
설문 조사의 주요 결과는 다음과 같습니다.
프로그래밍은 이제 생물학자들에게 필수적인 기술이며 대부분 독학입니다.
- 코딩은 이제 생명 공학 분야의 필수 기술입니다. 응답자 10명 중 8명 이상(87%)이 이제 코드를 작성합니다. 응답자의 55%는 매주 워크플로 자동화 스크립트를 작성하고 39%는 데이터 엔지니어링 또는 파이프라인을 매주 작성합니다.
- 대다수는 자신의 코딩 기술이 독학이라고 보고했습니다. 전체 응답자의 4분의 3(74%)이 일을 하면서 배웠고 63%는 학교나 교육을 통해 배웠습니다.
- Python은 가장 인기 있는 프로그래밍 언어였습니다. 참가자의 97%가 지난 12개월 이내에 데이터 분석을 수행하기 위해 사용했습니다. Shell(Bash/Powershell)이 그 다음으로 가장 인기 있는 코딩 언어(62% 사용)였으며 R(53%), SQL(41%), HTML/CSS(13%)가 그 뒤를 이었습니다.
대부분의 바이오 개발자들은 이미 기계 학습을 사용하고 있습니다.
- 기계 학습은 이제 생물학에서 잘 확립된 도구입니다. 이웃 개발자의 거의 4분의 3(73%)이 현재 업무에 기계 학습을 사용하고 있다고 말합니다. 기계 학습을 사용하는 사람의 26%는 매주 사용하고 20%는 매월 사용합니다.
- in silico 역할을 수행하는 사람 10명 중 4명은 현재 ML을 사용하고 있습니다. (80%), 현재 습식 실험실 과학자의 68%가 ML을 사용하고 있습니다.
- 기계 학습의 채택은 더욱 증가할 것입니다. 업무 결정에 머신 러닝을 아직 사용하지 않은 사람들의 82%가 미래에 사용하는 데 관심이 있습니다.
단백질 공학은 생합성 개발자의 우선 순위입니다.
- 단백질은 생합성 개발자에게 큰 관심 분야입니다.. 설문 조사에 따르면 응답자의 71%가 이미 단백질 공학 분야에서 일하고 있거나 미래에 탐구할 의향이 있는 것으로 나타났습니다.
- 단백질 공학은 다양한 응용 분야를 제공합니다. 효소, 항체, 짧은 펩타이드 및 유전자 조절 단백질이 모두 관심 분야였습니다. 53%의 사람들이 효소에 관심이 있고 44%는 향후 12개월 동안 유전자 조절 단백질에 대해 연구하고 싶어합니다.
생물학자들이 단백질을 보다 쉽게 설계하고 구축할 수 있도록 하기 위해 설립된 회사로서 우리는 생물학자들이 업무에 기술을 어떻게 사용하고 무엇을 위해 사용하는지 이해하고 싶었습니다. 생물학에서 코딩과 기계 학습의 역할이 증가하는 것을 보는 것은 좋은 일이며 벤치 과학자들이 작업을 계속하기 위해 이러한 도구를 수용하고 있다는 것이 분명합니다. AI 기술의 급속한 성장과 성숙기에 생물학자들이 앞으로 어떻게 일해야 하는지에 대한 벤치마크가 될 것 같습니다.
우리는 또한 단백질 디자인에 초점을 맞춘 것에 놀랐습니다. 단백질은 미래의 큰 과제를 해결하는 데 핵심적인 도구가 될 가능성이 있습니다. 기후 변화 및 오염 방지에서 질병 치료 및 식품, 의류, 재료 및 화학 물질에 대한 환경 친화적인 대체 자원 생성에 이르기까지. 세계에서 가장 중요한 많은 문제를 해결해야 하는 잠재적인 단백질에 대한 인식이 높아지고 있음을 보여주기 때문에 이 분야의 생물학 개발자들이 많은 관심을 보이는 것은 좋은 일입니다.”
Stef van Grieken, Cradle CEO 겸 공동 창립자
Bits in Bio는 소프트웨어와 과학의 교차점에서 구축하는 사람들을 위한 공간을 제공하기 위해 만들어졌습니다. 우리 업무의 중요한 부분은 커뮤니티에서 매일 사용하는 도구와 기술에 대한 피드백을 수집하는 것입니다. 이러한 결과를 널리 공유함으로써 우리는 모범 사례에 대해 바이오 개발자들 사이에 더 많은 의사 소통을 장려하기를 희망합니다. 소프트웨어는 과학적 발견에 점점 더 중요해지고 있으며 우리는 과학자와 개발자 모두가 이 흥미진진한 교차로를 탐색할 수 있도록 돕기 위해 최선을 다하고 있습니다.”
Bits in Bio의 창시자이자 Sphinx Bio의 CEO인 Nicholas LaRose-Stone
그만큼 생명공학의 경우 이 보고서는 전 세계 18개국의 157명의 응답자를 대상으로 한 설문 조사를 기반으로 합니다. 설문조사는 2022년 11월 28일부터 2023년 1월 5일까지 진행되었습니다.
원천:
저널 참조:
과학자들이 단백질을 설계하고 프로그래밍하는 데 도움이 되는 플랫폼인 Cradle은 오늘 최초의 바이오 개발자 설문 조사 결과를 발표했습니다. 이 설문 조사에서는 합성 생물학 분야 내에서 동향을 파악하기 위해 생물학적 개발자의 접근 방식과 우선 순위를 탐색했습니다.
"트위터를 통해 다양한 주제에 대한 생각을 나누는 아 동율은 정신적으로 깊이 있습니다. 그는 맥주를 사랑하지만, 때로는 그의 무관심함이 돋보입니다. 그러나 그의 음악에 대한 열정은 누구보다도 진실합니다."