전 세계적으로 거의 390 만 명의 사망자를 낸 코로나 바이러스 인 SARS-CoV-2의 원래 이야기를 찾는 것은 사례가 처음 등장한 중국의 정보에 대한 액세스 부족으로 인해 크게 방해를 받았습니다.
이제 시애틀의 한 연구원이 우한에서 발생한 COVID-19 초기 사례의 13 가지 부분 유전 적 서열을 드러내는 Google Cloud에서 삭제 된 파일을 발견했다고 Carl Zimmer는 뉴욕 타임즈.
시퀀스는 SARS-CoV-2가 어떻게 등장했을 수 있는지에 대한 많은 이론 중 하나를 향하거나 멀어지게 스케일을 기울이지 않습니다. 고도로 보호 된 실험실에서 유출되는 바이러스 우한에서는 자연적인 유출 사건을 암시하지 않습니다. 그러나 그들은 신종 코로나 바이러스가 수산물 시장의 첫 번째 대규모 발병보다 훨씬 일찍 확산되고 있다는 생각을 강조했습니다.
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바이러스의 기원과 위치를 정확히 파악하기 위해 과학자들은 소위 전구 바이러스 (다른 모든 균주가 유래 한 바이러스)를 찾아야합니다. 지금까지 첫 번째 염기 서열은 주로 2019 년 12 월 말 신종 코로나 바이러스가 처음 출현 한 곳으로 생각되었던 우한의 화난 수산물 시장에서 채취 한 샘플입니다. 2019 년 11 월 이전에는 시장 연결이 없었습니다. 감염병 세계적 유행 바이러스는 다른 곳에서 나타났습니다.
첫 번째 유전자 서열에는 성가신 문제가있었습니다. 시장에서 발견 된 사례에는 몇 주 동안 출시 된 사례의 바이러스 샘플에서 3 개의 누락 된 돌연변이가 포함됩니다. 이 세 가지 돌연변이가없는 바이러스는 코로나 바이러스 말굽 박쥐에서 발견됩니다. 과학자들은 새로운 코로나 바이러스가 어떻게 든 박쥐에서 나왔다고 확신하므로 조상도 이러한 돌연변이를 놓칠 것이라고 가정하는 것이 합리적입니다.
이제 시애틀에있는 Howard Hughes Medical Institute의 Jesse Bloom은 삭제 된 염기 서열 (첫 번째 샘플의 일부일 가능성이 있음)에도 이러한 돌연변이가 없음을 발견했습니다. (Bloom은 지난 5 월 사이언스 지에서 코로나 바이러스의 기원에 대한 편견없는 조사를 촉구하는 편지의 주 저자입니다. Live Science보고.)
블룸은 뉴욕 타임스에 “화난 수산 시장의 바이러스보다 박쥐 코로나 바이러스에 더 가깝다”고 말했다. Bloom은이 새로운 데이터는 바이러스가 해산물 시장에 등장하기 전에 우한에서 유포되고 있음을 나타냅니다.
“이 사실은 유전체 역학의 주요 초점 인 시장 순서가 WHO- 중국 공동 보고서 التقرير … 2019 년 12 월 말과 2020 년 1 월 초 우한에서 유포 된 바이러스를 대표하지 않는 블룸은 6 월 22 일에 사전 인쇄 데이터베이스에 업로드 된 자신의 논문에 썼습니다. bioRxiv.
Zimmer에 따르면, 약 1 년 전 코로나 바이러스 환자의 241 개의 유전자 염기 서열이 NIH (National Institutes of Health)에서 관리하는 Sequence Read Archive라는 온라인 데이터베이스에서 사라졌습니다.
Bloom은 2020 년 5 월 PeerJ 저널에 발표 된 연구에서 스프레드 시트를 발견했을 때 누락 된 서열을 발견했습니다. 저자는 2020 년 3 월 말까지 241 개의 SARS-CoV-2 유전자 서열을 나열했습니다. 시퀀스는 PRJNA612766이라는 Wuhan University 프로젝트의 일부였으며 시퀀스 읽기 아카이브에 업로드 된 것으로 추정됩니다. 그는 아카이브의 데이터베이스에서 시퀀스를 검색하고 “No elements found”라는 메시지를 받았다고 블룸은 동료 검토를 거치지 않은 bioRxiv 논문에 썼다.
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스파이 활동은 삭제 된 염기 서열이 우한 대학교의 Aisu Fu와 Renmin Hospital에서 수집 된 것으로 밝혀졌으며, 초기 발표 된 염기 서열 (Wang et al. 2020이라고 함)은 의심되는 외래 환자의 코 면봉 샘플에서 나온 것으로 나타났습니다. 전염병 초기에 COVID-19의 존재.
Bloom은 시퀀스가 삭제 된 이유에 대한 설명을 찾을 수 없었고, 그가 질문과 일치하는 두 저자에게 보낸 이메일에는 응답이 없었습니다.
Blum은 bioRxiv에 “결실에 대한 그럴듯한 과학적 이유는 없습니다. 서열은 Wang et al. (2020a, b)에 설명 된 샘플과 완전히 일치합니다.”라고 썼습니다. “논문에 대한 수정 사항이 없으며, 논문은 피험자의 동의를 얻었으며 시퀀싱에서 플라스미드 또는 샘플 간 오염의 증거를 보여주지 않습니다. 따라서 이들의 존재를 숨기기 위해 서열이 생략 된 것으로 보입니다.”
Bloom은 그의 연구에 대한 몇 가지 제한 사항을 지적합니다. 주로 염기 서열이 부분적 일 뿐이며 명확한 날짜 나 수집 장소를 제공하는 정보 (바이러스의 기원을 추적하는 데 필요한 정보)를 제공하지 않습니다.
그럼에도 불구하고 Bloom은 National Institutes of Health 및 기타 조직에서 보관 된 데이터를 더 자세히 살펴보고 시퀀스를 조합하면 SARS-CoV-2의 기원과 확산을 모두 명확하게 파악할 수 있다고 믿습니다. 중국에서 현장 연구를 위해.
삭제 된 시퀀스에 대해 자세히 알아보기 뉴욕 타임즈.
원래 Live Science에 게시되었습니다.
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