월요일, 5월 13, 2024

호주에서 사문석 잎채집인 Liriomyza huidobrensis(Blanchard, 1926)(Diptera: Agromyzidae)를 신속하게 식별하기 위한 두 가지 독립적인 LAMP 분석법

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Ae Dong-Yul
Ae Dong-Yul
"트위터를 통해 다양한 주제에 대한 생각을 나누는 아 동율은 정신적으로 깊이 있습니다. 그는 맥주를 사랑하지만, 때로는 그의 무관심함이 돋보입니다. 그러나 그의 음악에 대한 열정은 누구보다도 진실합니다."

잎사귀 유충은 숙주 식물의 잎 표면 사이에 있는 실질 조직에서 자라서 이를 먹으며 특징적인 광산 터널과 구리 침전물을 남깁니다. 잎 광부는 잎의 광합성을 줄이고, 잎의 분해를 증가시키며, 질병이 숙주에 유입되도록 하여 숙주 식물의 건강에 부정적인 영향을 미칠 수 있습니다.1. 잎 추출 행동은 곤충의 4목에서 진화했으며 초파리 9과에 존재합니다. 이들은 Agromyzidae Fallén(1823)의 3,163종 대부분에 널리 퍼져 있으며, 총체적으로 140과 이상의 숙주 식물에 먹이를 줍니다.2,,4. 다양한 아그로미지드(Agromyzids)는 농업 해충으로 간주되며, 이들 중 일부는 경제적으로 중요한 숙주 식물 전반에 걸쳐 고도로 폴리박테리아성이기 때문에 국제 무역에서 검역적으로 중요한 중요한 해충입니다. 리리오마이자 후이도브렌시스 (블랜차드, 1926), L. 사티바 블랜차드, 1938f L. 트리폴리이 (Burgess, 1880)은 이러한 중요한 해충들 사이에 널리 퍼져 있습니다.

이 세 가지 잎채굴 종은 아메리카 대륙에서 진화했지만, 각각 최근 서로 다른 지역에 정착한 호주를 포함하여 대부분의 다른 대륙의 고유 해충입니다.5,6,7. 현재 호주 국가 우선순위 식물 해충 목록에서 종합적으로 20위로 선정되었습니다.8. 각 해충은 경제적으로 중요한 다양한 원예 및 관상용 작물의 생산에 주요 위협을 가하는 것으로 인식됩니다. 특히, L. 호에도프린시스사문석 잎 광부(여기서는 SLM이라고 함)로 알려진 이 종은 2020년 뉴사우스웨일스의 시드니 전역에서 새로운 침입성 해충으로 모니터링 중에 도입되었습니다. SLM은 콩, 오이, 아시아 잎채소 등 해당 지역에서 재배되는 상업용 채소 작물에 광범위한 잎 손상을 일으킵니다.7.

SLM은 호주의 광범위한 농업 및 관상용 숙주 식물과 잡초에 영향을 미칠 수 있습니다.7그 중 대부분은 제공된 다른 두 호스트에서 사용되는 호스트입니다. 리레오메자 호주의 해충9. 이 확산 가능성 리레오메자 호주의 다양한 농업 및 생태 시스템과 지역의 해충 발생률이 높습니다.9. 영향을 받는 농업 및 관상용 산업은 이후 각 해충의 생물학적 특성과 숙주 및 기타 잎채굴 종과의 상호 작용에 따라 처리하기 위한 통합 해충 관리 전략을 개발해야 합니다.10,11,12,13. 이러한 맥락에서, 현장 조건에서 SBM 종을 정확하고 신속하게 식별하는 것은 특히 SBM이 새로운 지역이나 새로운 숙주 식물로 확산되는 경우 발병을 적시에 통제하고 관리하는 데 중요합니다.

자연적으로 존재하는 18가지가 있습니다. 리레오메자 호주의 종14. 고유종의 잎채굴종은 농업적으로 중요한 해충이 아닌 경우가 많습니다. 이들 종의 대부분에 대해 보고된 발생은 드물거나 역사적으로만 보고되었습니다(Atlas of Living Australia 참조; https://www.ala.org.au/). 현장에서 리프마이너 종을 직접 식별하는 것은 어렵고 관찰자 오류가 발생할 수 있습니다. 숙주 식물에서 쉽게 관찰할 수 있는 잎 광산은 해충 잎 채굴 활동이 존재함을 나타냅니다. 어떤 경우에는 지뢰 패턴과 숙주 식별이 특정 해충 유형을 나타낼 수 있습니다.7,15,16. 잎 채집인 성체 아그로미지드 종 분야에서 시각적 식별은 크기가 작고(아그로미지드 범위는 0.9~5.6mm) 진단에 사용되는 형태학적 특징이 미묘하기 때문에 실용적이지 않습니다. 많은 Agromizid 종은 공식적인 설명이 부족하며 대부분의 설명된 종은 몇 가지 관찰 가능한 형태적 특징에 의해서만 형제와 구별될 수 있습니다. 더욱이, 성체 암컷과 초기령 아그로미지드(Agromyzids)는 일반적으로 종 특유의 특징이 부족하며, 대부분의 종 식별은 성체 수컷의 해부학적 구조와 생식 기관의 현미경 검사를 기반으로 합니다. 일반적으로 해충을 모니터링하는 동안 종 식별을 위해서는 숙주에서 직접 포획하거나 영향을 받는 숙주 식물에서 채취한 잎채집령에서 사육된 성체 수컷 파리에 대한 실험실 분류학적 검사가 필요합니다. 후자의 경우 알에서 측정 가능한 성체로 발달하는 데 15~30일이 걸릴 수 있습니다.17,18이로 인해 우선순위 해충에 대한 경보 및 후속 관리 대응이 지연될 수 있습니다.

대안적으로, 분자 유전적 방법은 초파리와 주요 농작물 해충의 종 수준 식별을 제공할 수 있습니다. 미토콘드리아 시토크롬은 어머니로부터 유전됩니다. 산화효소 소단위 I(COI) 유전자는 경제적으로 중요한 일부 Agromizidae 종의 분자 인식을 위한 표적 유전자좌로 두드러지게 나타났습니다.19,2021. 5′ COI DNA 바코드 영역의 뉴클레오티드 서열.22 문서화된 표본에 연결된 표본을 통해 중요한 잎사귀 해충 종에 대한 유전자를 식별할 수 있다고 보고되었습니다.19,23. 이러한 서열 참조는 체외 유전자 진단 방법의 추가 개발 및/또는 침습적 식별의 필요성을 위한 기초를 형성했습니다. 리레오메자 호주의 해충24,25 그리고 다른 곳에서는20,26,27. 일부 농약의 계통발생 분석을 위해 보고된 28S 및 카바모일-인산 합성효소 2(CAD)를 포함한 핵 암호화 유전자 서열 그리고 리레오메자28 해충 잎 채굴자의 종 식별에 추가적인 이점을 제공합니다. 독립적으로 유전된 미토콘드리아 및 핵 유전자좌의 비교 서열 분석을 사용하여 형태학적 코드를 식별했습니다. 리레오메자 나누다28밀접하게 관련된 종 간의 잡종화 방향을 테스트합니다. 리레오메자 나누다29. 최근 정량적 중합효소연쇄반응(qPCR)을 기반으로 한 분자 식별 방법이 개발되었습니다. L. 호에도프린시스27긴급한 요구 사항 충족 리레오메자 차단방역. 그러나 이 qPCR 방법은 제한된 수의 비표적 종에 대해서만 테스트되었으며 호주에서의 적용 가능성을 확인하기 위해서는 여전히 검증이 필요합니다.

qPCR 및 뉴클레오티드 서열 분석과 같은 병변 유형을 식별하는 데 사용되는 유전적 방법은 실험실 처리 시간에 비해 몇 시간에서 며칠이 걸릴 수 있습니다. 이러한 지연은 실험실의 샘플 전달 및 등록과 결합되어 정확한 식별을 제공하고 해충의 존재에 대한 경보를 강화하는 데 필요한 시간을 증가시킵니다. 현장에서의 신속한 유전자 진단은 의심되는 SLM 차단을 확인하기 위한 신속한 테스트를 위해 선호되지만 현재 이러한 시스템은 개발 초기 단계에 있거나 상당하고/또는 값비싼 하드웨어가 필요합니다.

루프 매개 등온 증폭(LAMP)은 표적 유기체의 확인 및/또는 검출을 위한 저비용 기술입니다.30. LAMP는 표적 유기체의 DNA에 특이적으로 일치하는 프라이머 세트로 구성되며 표적 DNA의 결찰된 복사본을 빠르게 증폭하도록 설계되었습니다. LAMP는 양성 및 음성 테스트 결과를 간단하게 시각적으로 표시하기 위해 저렴한 장비에서 실행되는 원시 DNA 용해물을 테스트할 수 있으므로 현장에서 표적 해충 종을 식별하는 데 매우 적합합니다.31.

여기서 우리는 최근 호주의 SLM 조사 중에 샘플링된 리프마이너 종의 선택에 대해 SLM의 신속하고 구체적인 식별을 위한 민감한 LAMP 분석의 새로운 개발 및 검증에 대해 보고합니다. 또한 우리는 SLM LAMP 분석 결과의 현장 크로마토그래피 시각화를 단순화할 수 있도록 분석 수정을 보고합니다.

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