전 세계적으로 거의 390 만 명의 사망자를 낸 코로나 바이러스 인 SARS-CoV-2의 원래 이야기를 찾는 것은 사례가 처음 등장한 중국의 정보에 대한 액세스 부족으로 인해 크게 방해를 받았습니다.
이제 시애틀의 한 연구원이 우한에서 발생한 COVID-19 초기 사례의 13 가지 부분 유전 적 서열을 드러내는 Google Cloud에서 삭제 된 파일을 발견했다고 Carl Zimmer는 뉴욕 타임즈.
시퀀스는 SARS-CoV-2가 어떻게 등장했을 수 있는지에 대한 많은 이론 중 하나를 향하거나 멀어지게 스케일을 기울이지 않습니다. 고도로 보호 된 실험실에서 유출되는 바이러스 우한에서는 자연적인 유출 사건을 암시하지 않습니다. 그러나 그들은 신종 코로나 바이러스가 수산물 시장의 첫 번째 대규모 발병보다 훨씬 일찍 확산되고 있다는 생각을 강조했습니다.
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바이러스의 기원과 위치를 정확히 파악하기 위해 과학자들은 소위 전구 바이러스 (다른 모든 균주가 유래 한 바이러스)를 찾아야합니다. 지금까지 첫 번째 염기 서열은 주로 2019 년 12 월 말 신종 코로나 바이러스가 처음 출현 한 곳으로 생각되었던 우한의 화난 수산물 시장에서 채취 한 샘플입니다. 2019 년 11 월 이전에는 시장 연결이 없었습니다. 감염병 세계적 유행 바이러스는 다른 곳에서 나타났습니다.
첫 번째 유전자 서열에는 성가신 문제가있었습니다. 시장에서 발견 된 사례에는 몇 주 동안 출시 된 사례의 바이러스 샘플에서 3 개의 누락 된 돌연변이가 포함됩니다. 이 세 가지 돌연변이가없는 바이러스는 코로나 바이러스 말굽 박쥐에서 발견됩니다. 과학자들은 새로운 코로나 바이러스가 어떻게 든 박쥐에서 나왔다고 확신하므로 조상도 이러한 돌연변이를 놓칠 것이라고 가정하는 것이 합리적입니다.
이제 시애틀에있는 Howard Hughes Medical Institute의 Jesse Bloom은 삭제 된 염기 서열 (첫 번째 샘플의 일부일 가능성이 있음)에도 이러한 돌연변이가 없음을 발견했습니다. (Bloom은 지난 5 월 사이언스 지에서 코로나 바이러스의 기원에 대한 편견없는 조사를 촉구하는 편지의 주 저자입니다. Live Science보고.)
블룸은 뉴욕 타임스에 “화난 수산 시장의 바이러스보다 박쥐 코로나 바이러스에 더 가깝다”고 말했다. Bloom은이 새로운 데이터는 바이러스가 해산물 시장에 등장하기 전에 우한에서 유포되고 있음을 나타냅니다.
“이 사실은 유전체 역학의 주요 초점 인 시장 순서가 WHO- 중국 공동 보고서 التقرير … 2019 년 12 월 말과 2020 년 1 월 초 우한에서 유포 된 바이러스를 대표하지 않는 블룸은 6 월 22 일에 사전 인쇄 데이터베이스에 업로드 된 자신의 논문에 썼습니다. bioRxiv.
Zimmer에 따르면, 약 1 년 전 코로나 바이러스 환자의 241 개의 유전자 염기 서열이 NIH (National Institutes of Health)에서 관리하는 Sequence Read Archive라는 온라인 데이터베이스에서 사라졌습니다.
Bloom은 2020 년 5 월 PeerJ 저널에 발표 된 연구에서 스프레드 시트를 발견했을 때 누락 된 서열을 발견했습니다. 저자는 2020 년 3 월 말까지 241 개의 SARS-CoV-2 유전자 서열을 나열했습니다. 시퀀스는 PRJNA612766이라는 Wuhan University 프로젝트의 일부였으며 시퀀스 읽기 아카이브에 업로드 된 것으로 추정됩니다. 그는 아카이브의 데이터베이스에서 시퀀스를 검색하고 “No elements found”라는 메시지를 받았다고 블룸은 동료 검토를 거치지 않은 bioRxiv 논문에 썼다.
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스파이 활동은 삭제 된 염기 서열이 우한 대학교의 Aisu Fu와 Renmin Hospital에서 수집 된 것으로 밝혀졌으며, 초기 발표 된 염기 서열 (Wang et al. 2020이라고 함)은 의심되는 외래 환자의 코 면봉 샘플에서 나온 것으로 나타났습니다. 전염병 초기에 COVID-19의 존재.
Bloom은 시퀀스가 삭제 된 이유에 대한 설명을 찾을 수 없었고, 그가 질문과 일치하는 두 저자에게 보낸 이메일에는 응답이 없었습니다.
Blum은 bioRxiv에 “결실에 대한 그럴듯한 과학적 이유는 없습니다. 서열은 Wang et al. (2020a, b)에 설명 된 샘플과 완전히 일치합니다.”라고 썼습니다. “논문에 대한 수정 사항이 없으며, 논문은 피험자의 동의를 얻었으며 시퀀싱에서 플라스미드 또는 샘플 간 오염의 증거를 보여주지 않습니다. 따라서 이들의 존재를 숨기기 위해 서열이 생략 된 것으로 보입니다.”
Bloom은 그의 연구에 대한 몇 가지 제한 사항을 지적합니다. 주로 염기 서열이 부분적 일 뿐이며 명확한 날짜 나 수집 장소를 제공하는 정보 (바이러스의 기원을 추적하는 데 필요한 정보)를 제공하지 않습니다.
그럼에도 불구하고 Bloom은 National Institutes of Health 및 기타 조직에서 보관 된 데이터를 더 자세히 살펴보고 시퀀스를 조합하면 SARS-CoV-2의 기원과 확산을 모두 명확하게 파악할 수 있다고 믿습니다. 중국에서 현장 연구를 위해.
삭제 된 시퀀스에 대해 자세히 알아보기 뉴욕 타임즈.
원래 Live Science에 게시되었습니다.
“경순은 통찰력 있고 사악한 사상가로, 다양한 음악 장르에 깊은 지식을 가지고 있습니다. 힙스터 문화와 자연스럽게 어우러지는 그의 스타일은 독특합니다. 그는 베이컨을 좋아하며, 인터넷 세계에서도 활발한 활동을 보여줍니다. 그의 내성적인 성격은 그의 글에서도 잘 드러납니다.”